Сюжет Лило - девочка, которая живёт вместе со своей старшей сестрой Нани, т.к. их родители погибли. Лило увлекается танцами, любит заниматься дайвингом и фотографировать. У неё много странных хобби, из-за чего другие девочки не принимают её, поэтому Лило чувствует себя одиноко. Чтобы ей было не так грустно, Нани разрешает Лило взять собаку из приюта. Она называет его Стич. Только вот собака оказывается инопланетянином, который сбежал из галактической тюрьмы. Стич непослушный, взбалмошный, беспокоится только о себе, всё вокруг себя крушит...

Злой гений Джамба Джукиба обвиняется в создании 626 незаконных генетических образцов. Доказательством является эксперимент № 626, которого отправляют на астероид в межгалактическую тюрьму. Однако ему удаётся бежать на Землю. Чтобы остановить его, Совет Галактической Федерации решает отправить вслед его создателя — Джамбу Джукибу и эксперта по Земле агента Венди Пликли, он должен присматривать за Джамбой. 626 приземляется на гавайский остров Кауаи и попадает в приют для собак, прикидывается собакой и решает использовать земную девочку по имени Лило в качестве прикрытия...