Событие второй части манги происходит спустя два с половиной года их странствий с Дзирайей. Вернувшийся в Коноху и повзрослевший Наруто стал более сильным и умным, но, в отличие от сверстников, остался в звании гэнина. Первой крупной миссией стало спасение похищенного группировкой Акацуки Гаары: в то время как Сасори был уничтожен Сакурой и Тиё, Наруто вместе с Какаси преследовал Дэйдару, которому всё-таки удалось сбежать, сымитировав свою смерть. Ослабленный использованием в погоне сярингана Какаси...

Эпизод 254 "Сверхсекретная Миссия S-Ранга" Сюжет возвращает нас к острову и мы видим, что: Тут же мы узнаём, что остров - не просто остров, а ГРОМАДНАЯ черепаха Генбу. А вот на самом Генбу располагается черепаха поменьше, которая в диалоге с черепахой Гая, называет себя "маленькой черепашкой", в какой-то версии перевода понятно, что ДЕТЁНЫШЕМ (хотя, звучит она как настоящий старец). Т.к эта черепаха является ЧАСТЬЮ ЛАНДШАФТА, то предположу, что это реальный детёныш Гебну. Просто вот такая порода черепах, которые и как рептилии, и как сросшиеся с землёй сущности, части пейзажа...