История рассказывает о Джо Хигане, бывшем ниндзя, который сбежал из своего клана и скрывается от своего прошлого в сельской местности Америки. Однажды ночью он попадает в засаду группы убийц из своего бывшего клана, которые хотят отомстить ему за предательство их древнего кодекса. Восстав из своей предполагаемой "смерти", Джо вновь становится ниндзя Камуи, чтобы отомстить за свою семью и друзей. Камуи - ниндзя 21 века, который с жестокой утонченностью противопоставляет свои древние навыки высокотехнологичному оружию...

«Ниндзя Камуи» — это захватывающее аниме, которое сочетает в себе классические элементы жанра ниндзя с современным экшеном и драмой. Сюжет рассказывает о Камуи, мастере ниндзя, который после долгих лет скрытности вынужден вернуться к своему опасному ремеслу, чтобы защитить своих близких и отомстить врагам. Главный герой — Камуи — живёт под чужим именем в тихом городе, пытаясь забыть своё прошлое. Однако когда его семья оказывается в опасности из-за старых врагов из клана ниндзя, он вынужден вновь надеть маску и использовать все свои навыки, чтобы выжить и восстановить справедливость...