Даже сокращенные варианты предлагают разные: Софья – это, мол, Соня, а София – это Софа. Имя это этимологически, конечно, одно. Известно, что в окончании – ия было краткое [и], которое в литературной форме перешло в полноценный звук [и], а в разговорном сократилось еще больше до звука [j] (он не пишется, но предполагается в некоторых гласных). Такое происходит во многих именах, но нигде нет такого противоборства, как между Софьей и Софией: Наталья и Наталия, Мария и Марья, даже Анастасия и Настасья...

Родиной женского имени София считается Греция. В нашем русском мире имя изменило звучание до Софьи. Так было не просто удобнее произносить имя. Так полностью менялись акценты и задачи носительницы имени. София - мудрая за счёт познания. Софья - мудрость от природы. Русские люди любят упростить в хорошем смысле слова. Убрать лишнее, усилить лучшее. Вариант Софья - гармоничнее и счастливее для жизни. Сами посмотрите с позиции построения имени: Со-Фи-Я. В имени София - три слога и три задачи. Три ступеньки к своему счастью...