Инуяся История начинается в Токио и знакомит нас с Кагомэ Хигураси, ученицей средней школы, которая ведёт обычную жизнь. Её семья на протяжении многих поколений управляет синтоистским храмом, что придаёт ей особую связь с традициями и духовностью. Однажды, возвращаясь из школы, Кагомэ заглядывает в небольшую пристройку к храму, где находится старый, высохший колодец. Её младший брат Сота рассказал ей, что их домашний кот, Буё, упал в него, но сам боится заходить внутрь. С любопытством и желанием помочь брату, Кагомэ подходит к колодцу...