Злодеи это одно, а вот антигерои совсем другое. Антигерои по сути тоже лишь частично считаются злодеями, но официально их злодеями назвать нельзя. Они считают, что действуют так правильно, так как сами они считают себя героями, даже если им приходится идти на злодеяния...
После поражения их старейшего врага Шредера, семья черепашек распалась. Кроме борьбы за единство семьи их сенсей Сплинтер обеспокоен еще и тем, что в Нью-Йорке происходит что-то странное. Техноиндустриалист Максимилиан Уинтерс готовит армию древних монстров, остановить которую сможет только суперкоманда бойцов ниндзя — Леонардо, Микеланджело, Донателло и Рафаэль. Вместе со своими прежними соратниками Эйприл О`Нил и Кейси Джонсом Черепашки снова сражаются за свои жизни, им снова предстоит противостоять...