Предыдущая часть Ранее крысоловы напали на Эйприл и Сплинтера в их логове, а черепашки пришли на помощь. Все вместе они узнали, что в разрушениях и нападениях виноват сам Шреддер и компания человека по имени Бакстер Стокман. Шреддер отпускает Стокмана домой, но своим футботам приказывает избавиться от него позже. Сам же Саки решает отправить сто крысоловов на черепах. С помощью Эйприл черепахи нашли жилище Бакстера и уже поджидали его у квартиры. Как только Стокман подошел к двери на него напали футботы, с которыми в последствии разобрались черепашки ниндзя...

Первые приключения знаменитых героев в панцирях. Приключения начинаются с новостей Эйприл О'нил об ограблении трёх научных лабораторий, в которых украли высокотехнологичное оборудование, а так же эксперты подозревают в этом ниндзя. Только окончив репортаж, Эйприл прерывают громилы, чтобы преподать урок, но она технично бросает в них камеру и решает сбежать через канализацию. Преступники бросаются вдогонку по канализации за Эйприл. В момент, когда девушку догоняют бандиты, она спотыкается и падает...