За свою долгую жизнь в комиксах, черепашки-ниндзя столкнулись с довольно интересными и сильными соперниками. Так, они сражались с инопланетянами, с бесконечными ниндзя Шреддера, динамичным дуэтом Рокстэди и Бибопом, различными роботами, Демоном Ёкай и т...

Черепашки-ниндзя имеют за плечами огромный опыт совместной работы с другими супергероями. Они объединялись с охотниками за приведениями, Бэтменом, Усаги Ёдзимбо и т.д. И пусть они живут в Нью-Йорке, они никогда не имели пересечений с персонажами вселенной Марвел...