Предыдущая часть Ранее крысоловы напали на Эйприл и Сплинтера в их логове, а черепашки пришли на помощь. Все вместе они узнали, что в разрушениях и нападениях виноват сам Шреддер и компания человека по имени Бакстер Стокман. Шреддер отпускает Стокмана домой, но своим футботам приказывает избавиться от него позже. Сам же Саки решает отправить сто крысоловов на черепах. С помощью Эйприл черепахи нашли жилище Бакстера и уже поджидали его у квартиры. Как только Стокман подошел к двери на него напали футботы, с которыми в последствии разобрались черепашки ниндзя...

Спустя год после битвы на вершине Сакс-Тауэр, четверо братьев-черепашек: Леонардо (Лео), Донателло (Донни), Микеланджело (Майки) и Рафаэль (Раф) продолжают жить беззаботной жизнью подростков-ниндзя. Чтобы не раскрывать себя, они договорились о том, что лавры человека, остановившего Эрика Сакса и Клан Фут со Шреддером во главе, присвоит себе Вернон Фенвик. Он получает «Ключ от Города» и становится популярной медиа-звездой по кличке «Сокол». Каждого из черепашек-ниндзя тяготит то, что они не могут...