Пятнадцать лет назад мастер ниндзюцу Хамато Йоси купил в нью-йоркском зоомагазине четырех очаровательных черепашек. По дороге домой он столкнулся с таинственными злоумышленниками, которые втянули его в драку. Из рук злодеев выпал контейнер с неизвестным веществом, под действием которого Хамато мутировал в огромную антропоморфную крысу. К счастью, он не растерял своих боевых навыков и мудрости. Одновременно удивительные метаморфозы произошли и с его новыми питомцами – встав на задние лапы, они обрели человеческий разум и фантастическую силу...

В 1983 году два друга и два независимых художника комиксов Кевин Истмен и Питер Лэрд, сидя дома перед телевизором, начинают рисовать карикатуры. Тем же вечером на свет появились первые изображения гуманоидных черепах, стоящих на двух лапах и держащих в руках оружие ниндзя. Концепция очень понравилась авторам и они решились на создание полноценного комикса, с участием этих чудных созданий. Изначально черепашкам хотели присвоить японские имена, но в конечном итоге их решили назвать в честь итальянских художников эпохи Возрождения — Леонардо, Донателло, Микеланджело и Рафаэлем...