Давным-давно в глубине японских лесов, где таинственные и мистические силы пронизывали природу, обитали обычные морские черепахи. Эти черепахи жили спокойной жизнью, плавая в воде и загорая на солнце. Но однажды в их мире произошли огромные изменения, и началась новая эпоха легендарных Черепашек-Ниндзя. Началом послужило падение таинственного метеорита, недалеко от места пребывания черепашек, в обломках которого были обнаружены четыре странных амулета, которые излучали радиоактивные частицы. В то же время от них исходило невообразимое свечение и невероятная энергия...

Однажды, когда в Нью-Йорке, где жили Черепашки-ниндзя был тёмный вечер. В это время они смотрели очередной фильм. При просмотре фильма Черепашки ели пиццу и пили сок. Сплинтер в это время занимался упражнениями в своей комнате Вдруг, программа по телевизору быстро прекратилась и на экране появился Шредер. Он запрограммировал Черепашек на драку с Сплинтером. Фильм закончился, и Черепашки пошли в комнату где находился их учитель. Они зашли вчетвером и резко напали на Сплинтера...