Черепашки-ниндзя имеют за плечами огромный опыт совместной работы с другими супергероями. Они объединялись с охотниками за приведениями, Бэтменом, Усаги Ёдзимбо и т.д. И пусть они живут в Нью-Йорке, они никогда не имели пересечений с персонажами вселенной Марвел...

Давным-давно в глубине японских лесов, где таинственные и мистические силы пронизывали природу, обитали обычные морские черепахи. Эти черепахи жили спокойной жизнью, плавая в воде и загорая на солнце. Но однажды в их мире произошли огромные изменения, и началась новая эпоха легендарных Черепашек-Ниндзя. Началом послужило падение таинственного метеорита, недалеко от места пребывания черепашек, в обломках которого были обнаружены четыре странных амулета, которые излучали радиоактивные частицы. В то же время от них исходило невообразимое свечение и невероятная энергия...