История разворачивается вокруг замкнутой и одинокой девочки по имени Анна Сасаки. Из-за астмы и эмоциональных проблем Анна живёт без настоящих друзей и чувствует себя лишней в своей приёмной семье. Чтобы улучшить её здоровье, приёмная мать отправляет её на лето к родственникам в деревню. В этом тихом и живописном месте Анна обращает внимание на старинный заброшенный особняк, расположенный в болотистой местности. Дом производит на неё глубокое впечатление, и вскоре она встречает загадочную девочку по имени Марни, которая живёт в этом доме...