Давай закроем глаза и попытаемся вспомнить, как приятно ветер обдувает лицо летом, как весело помочить ножки в речке, как вкусно кушать арбуз. Аниме берёт начало своего повествования с летнего дня. Хотару, шестилетняя девочка, заблудившаяся в лесу, сидит и плачет от безысходности. Но вот, из ниоткуда, возникает парень в традиционной японской маске, который пообещал ей помощь, от чего в нашей юной героине, совсем недавно отчаявшейся покинуть злаполучный лес, пробудилось желание крепко обнять спасителя, за что она тут же получила палкой по голове...

В лес где мерцают светлячки — короткометражное аниме начинается с превосходного пейзажа, тумана над горами и озером в котором цветут необычайно красивые лилии. Каждое лето нечто тянет милую девушку Хотару при поездке к дедушке ходить в лес, где живут духи. Там она встречает одного лесного жителя по имени Гин, который когда то помог ей выбраться из леса в котором она потерялась. Его отношение к ней по началу было не самым доброжелательным, но и его можно понять, они обязаны избегать людей...