Событие второй части манги происходит спустя два с половиной года их странствий с Дзирайей. Вернувшийся в Коноху и повзрослевший Наруто стал более сильным и умным, но, в отличие от сверстников, остался в звании гэнина. Первой крупной миссией стало спасение похищенного группировкой Акацуки Гаары: в то время как Сасори был уничтожен Сакурой и Тиё, Наруто вместе с Какаси преследовал Дэйдару, которому всё-таки удалось сбежать, сымитировав свою смерть. Ослабленный использованием в погоне сярингана Какаси...

Эпизод 168 "Четвёртый Хокаге" Возможности "чакро-программирования" Итак, всех кто успел подумать, что Минато каким-то образом выжил и 16 лет скрывался в пузе у сына, спешат образумить, поясняя, что НЕТ, это просто особое устройство Печати и Минато просто всплыл в сознании Наруто, представляя из себя, по сути, ЗАЩИТНЫЙ МЕХАНИЗМ! Малюсенький предохранитель на случай ЧП, при этом являясь полноценным АРХИВОМ сознания Четвёртого с ограниченным запасом чакры, будто бы Минато поместил сюда ТЕНЕВОГО КЛОНА,...