Событие второй части манги происходит спустя два с половиной года их странствий с Дзирайей. Вернувшийся в Коноху и повзрослевший Наруто стал более сильным и умным, но, в отличие от сверстников, остался в звании гэнина. Первой крупной миссией стало спасение похищенного группировкой Акацуки Гаары: в то время как Сасори был уничтожен Сакурой и Тиё, Наруто вместе с Какаси преследовал Дэйдару, которому всё-таки удалось сбежать, сымитировав свою смерть. Ослабленный использованием в погоне сярингана Какаси...

Эпизод 252 "Ангел Смерти". Вот и закончилось лето... Всех с Днём Знаний, и мы тоже сегодня кое-что попробуем узнать. Серия начинается с сцены в убежище Мадары и вообще, этого момента нет в манге и мы сразу же видим Тоби, пришедшего в Амегакуре, НО каково же ЗЛОДЕЙСКОЕ ЛОГОВО перед нами предстаёт, прямо по всем канонам сборников стереотипов: Три странных типа, скользкое змее-чудище, странное растение-чудище и пафосный аноним, пересекаются в своих ТЁМНЫХ зловещих тоннелях, что бы перекинуться парой словечек о предстоящем злодеянии...