"Космический линкор “Ямато 2199” - это аниме, которое переносит зрителей в далекое будущее, когда Земля была захвачена инопланетными существами, известными как Гамилус. Человечество вынуждено было бежать на другие планеты, чтобы сохранить свою цивилизацию. Один из таких кораблей - космический линкор “Ямато”, который отправляется на поиски нового дома для людей. Сюжет аниме разворачивается вокруг команды космического корабля “Ямато”. Капитан корабля - Ичиро Хаяма, молодой и амбициозный командир, который готов вести свою команду к победе...

Человечество на протяжении многих лет пытается покорить космос. Пока деятельность людей больше смахивает на скромные исследования, а не на грандиозные подвиги. Хотя можно попытаться представить, что землянам всё же удалось расширить границы собственных познаний о вселенной. Население освоило новые территории и даже создало поселение в межзвездном пространстве, что автоматически превратилось в опасность для основной планеты. Развернулась нешуточная война, успевшая унести гигантское количество невинных душ...