Гомункулы были антагонистами сериала, хотя иногда и они совершали добрые дела. Они запоминаются не только из-за отвратительных действий, которые совершают на протяжении всей серии, но и потому, что они хорошо прописанные, многогранные персонажи с большой глубиной. Это относится даже к такому персонажу, как Зависть, по которому изначально кажется, что он просто получает удовольствие от человеческих страданий без всякой причины, но позже выясняется, что это происходит из-за глубокой ревности к тому, что они никогда не смогут походить на людей...

В пятой части появляется ещё один злодей Алчность. Он похищает Альфонса и пытается выведать у него тайну человеческой трансмутации, вот только Ал совсем не помнит, что с ним происходило, когда он потерял своё тело. На помощь приходит, конечно же, Эдвард, а так же Кинг Брэдли, великий и ужасный глава всех государственных алхимиков. Оказывается, ему тоже есть, что скрывать. Чем дальше продвигаешься, тем тщательнее приходится подбирать слова, чтобы что-то не спойлернуть...