Событие второй части манги происходит спустя два с половиной года их странствий с Дзирайей. Вернувшийся в Коноху и повзрослевший Наруто стал более сильным и умным, но, в отличие от сверстников, остался в звании гэнина. Первой крупной миссией стало спасение похищенного группировкой Акацуки Гаары: в то время как Сасори был уничтожен Сакурой и Тиё, Наруто вместе с Какаси преследовал Дэйдару, которому всё-таки удалось сбежать, сымитировав свою смерть. Ослабленный использованием в погоне сярингана Какаси...

Эпизод 202 "Молния против Молнии". Интерес Тоби Тоби появляется, а Наруто демонстрирует нам молниеносный навык формирования дзюцу: призванный клон и закрученный Расенган буквально за мгновение. Интересно, что по идее Наруто попал в подоконник (балкон?) на котором сидел Мадара, но энергия Расенгана ударила ВВЕРХ, разворотив крышу. И да, мне кажется, что не владей Обито своим Камуи, а будь обычным шиноби, то его могло бы задеть ударом, а так, он по сути просто дематериализовался и отошёл в сторону, в то время, как все щепки и энергия прошли сквозь него...