Если коробка начала вибрировать, то это не значит, что дело именно в ней. КПП жёстко связана с двигателем, сцеплением, приводами, опорами и рычагом переключения. Это одна система, и коробка часто просто передаёт чужую вибрацию дальше, как провод передаёт ток от розетки к лампочке. Откуда берётся вибрация. Это встреча источника колебаний и пути, по которому они доходят до кузова. Источник обычно маленький: люфт втулки, севшая опора, перекос диска сцепления. Но если частота этих колебаний совпадает с резонансом рычага или троса, то водитель чувствует сильную тряску...