Найти в Дзене
С точки зрения биоинформатики: ВИЧ. Часть 2. Молекулярная биология вируса.
В первой части мы разобрали историю эпидемии ВИЧ, в второй части разберём этот вирус с точки зрения молекулярной биологии. За 30 лет непрерывного активного изучения ВИЧ стал одним из самых изученных биологических объектов на планете. На представленной картинке, полученной с электронного микроскопа, мы видим вирус, окруженный липидной оболочкой, внутри которой находится его геном Его размер очень маленький - 100 nm По сравнению с песчинкой этот вирус такого же масштаба как песчинка по отношению к 3-х этажному дому...
2 недели назад
С точки зрения биоинформатики: ВИЧ. Часть 1. История и хроника распространения ВИЧ в России и мире.
История эпидемии, изменившей мир, началась с короткой заметки, опубликованной 5 июня 1981 года в специализированном издании MMWR (Morbidity and Mortality Weekly Report) — еженедельном отчете Центров по контролю и профилактике заболеваний США (CDC). Пневмоцистная пневмония в Лос-Анджелесе.В период с октября 1980 по май 1981 года у пятерых молодых, ранее здоровых мужчин, являющихся активными гомосексуалистами, в разных больницах Лос-Анджелеса был лабораторно подтвержден случай пневмоцистной пневмонии...
3 недели назад
Добрый день! Хотели бы рассказать Вам про наш студенческий стартап "Секвенирование у кровати (у стола)" Данный стартап основан на объединении в одном портативном, переносном устройстве(вес до 1кг, размер до 30 см) следующих компонентов: Секвенатора Нанопорус (Россия) с ячейкой Flongle [1] от Oxford Nanopore, платы Nvidia Jetson(для массивных параллельных вычислений на GPU), 7" сенсорного экрана, SSD-диска на 2TB, Амплификатора на 1 пробирку, Дозатора. В начальной версии на самом устройстве реализован пайплайн для определения резистентности ВИЧ-1. За основу была взята работа филиппинского университета De La Salle [2] адаптированная под локальную базу данных о ВИЧ-резистентности Stanford HIV Drug Resistance Database [3]. В последующих версиях мы хотим добавить биоинформатический маркетплейс с решениями для определения резистентности у других патогенов, например, у мико-бактерий туберкулеза Себестоимость одного запуска прибора состоит из стоимости ячейки Flongle и химии для выделения ДНК и составляет примерно 25 тыс.рублей. Но есть все основания полагать, что данная сумма с разбитием технологий значительно уменьшится в будущем. Для нас было бы крайне ценно получить мнение и обратную связь. Ссылка - forms.yandex.ru/...dit [1] oxfordnanoporedx.com/...gle [2] github.com/...ine [3] hivdb.stanford.edu
6 месяцев назад