18 подписчиков
И так, первый мой пост на моём канале. Надеюсь, будет кому-то интересно. Сегодня хотел бы поговорить о таком интересном белке, как SOX8 и его роли в возникновении организме человека. Честно сказать, был поражён, на сколько у нас непопулярна эта тема, хотя данный белок безусловно один из важнейших в организме.
Официальное название гена: SOX8. Семейство белков: SOX (SRY-related HMG-box). Тип белка: Транскрипционный фактор. Длина аминокислотной последовательности: 465 aa. Молекулярная масса: ~50 kDa. Организм происхождения: Человек (Homo sapiens).
SOX8 является членом семейства транскрипционных факторов SOX, регулирующих ключевые процессы развития организма, включая развитие нервной системы, половых желез, костной ткани и иммунной системы. Белок взаимодействует с ДНК посредством HMG-домена, специфически связываясь с группами (A/T)(A/T)CAA(A/T).
Основные биологические роли включают:
- Регуляция экспрессии генов, участвующих в развитии мозга и периферической нервной системы.
- Участие в формировании половых признаков и дифференцировке клеток репродуктивной системы.
- Роль в развитии костей и хрящей, влияя на формирование скелета.
- Потенциальная роль в иммунологических процессах и регенерации тканей.
Белок состоит из двух основных структурных элементов:
- HMG-домен: Отвечает за специфическое взаимодействие с ДНК и распознавание регуляторных последовательностей.
- C-концевой регион: Участвует в активации транскрипции и взаимодействии с коактиваторами.
Известные взаимодействия:
- SOX8 взаимодействует с различными факторами транскрипции и белками ремоделирования хроматина, усиливая экспрессию целевых генов, а также работая как направляющая.
- Формирует комплексы с такими молекулами, как SOX9 и SOX10, участвуя в регуляции общих путей развития.
Мутации в гене SOX8 связаны с несколькими заболеваниями и состояниями:
- Синдром Каллмана (активация остальных патологических генов).
- Нарушения полового развития, такие как гипогонадизм и крипторхизм.
- Заболевания опорно-двигательного аппарата, включая нарушения формирования суставов и кости.
- Возможная связь с развитием некоторых форм рака и опухолей, хотя точные механизмы остаются предметом исследований.
Патогенный вариант A0AAA9YHN4 имеет в своей структуре петлю LAPASAAG, которая, в свою очередь, приводит к нарушению формирования глобулы, ввиду чего белок не может выполнять свою роль фактора транскрипции.
SOX8 является членом семейства факторов транскрипции SOXE наряду с SOX10 и SOX9 . У мутантных мышей Sox8 наблюдается прогрессирующее мужское бесплодие наряду с идиопатической потерей веса [Sock et al., 2001; O'Bryan et al., 2008]. Недавно были идентифицированы три пациента с НПД 46,XY с вариантами, вовлекающими ген SOX8 [Portnoi et al., 2018]. Два человека с НПД 46,XY несли геномные перестройки, охватывающие локус SOX8 , а третий человек нес вариант в пределах HMG-бокса гена SOX8 . Это подчеркивает, что, несмотря на прогнозируемую избыточность функции SOX9 и SOX8 во время дифференцировки гонад [Chaboissier et al., 2004], возможно, что каждый из них также имеет уникальные функции, и, следовательно, мы наблюдаем отсутствие надлежащей дифференцировки гонад при отсутствии каждого из них по отдельности. Варианты SOX8 были обнаружены с большей частотой у мужчин и женщин с олигозооспермией и первичной недостаточностью яичников (ПНЯ) по сравнению с фертильными контрольными группами [Portnoi et al., 2018], что подтверждает прогрессирующее мужское бесплодие, наблюдаемое у мышей с нулевым геном Sox8.
Анализ через AlphaFold Server показал, что SOX8 является белком-направляющей, что, при взаимодействии с ДНК, вызывает изгиб под углом +- 60 градусов в нормальном состоянии и +- 45 в мутантном. Также идёт существенное различие в повороте ДНК, на котором идёт изгиб. Разница между мутантной и базовой молекулой вызвана нарушением формирования HMG-домена, ввиду чего нарушается узнавание ДНК.
3 минуты
10 апреля