405 подписчиков

🗣 Марк Иванов – к.ф.-м.н., научный сотрудник Института энергетических проблем химической физики им. В.Л. Тальрозе ФИЦ ХФ им. Н.Н. Семенова РАН. и обладатель премии за 4 место в конкурсе научных работ Фонда «Развитие химической физики».

📋 Марк Витальевич представил на конкурсе работу, посвященную метоу быстрого хроматомасс-спектрометрического анализа протеомов для решения задач в области биологии и персонализированной медицины.

В рамках работы отмечается, что одной из проблем существующих методов анализа белков, основанных на тандемной хроматомасс-спектрометрии, является низкая скорость, достигающая нескольких часов затрат инструментального времени на один образец, что ограничивает их широкое использование в биологии и медицине.

Автором был создан метод быстрого анализа протеомов — DirectMS1. Он основан на идентификации белков без использования фрагментации ионов, чем отличается от других методов. DirectMS1 представляет собой совокупность инновационных подходов как к получению экспериментальных данных, так и к обработке данных на основе машинного обучения. DirectMS1 позволил на порядок сократить время анализа, за счет чего появилась возможность осуществления более масштабных научных проектов с анализом сотен образцов вместо десятков.

Анализ белков без использования фрагментации применялся около 20-25 лет назад. Однако в тех случаях речь шла об анализе простых смесей (десятки белков), в то время как предложенный метод успешно идентифицирует до 3000 белков. Чего-то аналогичного по совокупности факторов (сложность анализируемой смеси, скорость анализа и точность количественных оценок белков) не существовало. И даже сейчас представлены лишь единичные работы, составляющие конкуренцию созданному методу.

Последние несколько лет лаборатория автора работы реализует ряд различных проектов, в которых метод успешно используется в качестве альтернативы традиционным подходам. Кроме того, метод открыл новые возможности для анализа отрицательно заряженных ионов пептидов (Penanes et al., Journal of Proteome Research, 2023).

Поздравляем Марка Витальевича с победой в конкурсе и желаем новых научных открытий👏

🗣 Марк Иванов – к.ф.-м.н., научный сотрудник Института энергетических проблем химической физики им. В.Л. Тальрозе ФИЦ ХФ им. Н.Н. Семенова РАН.

1 минута

12 сентября 2024