Годы, в которые будущий святитель учился в Афинском университете, были не лучшими в духовной жизни Греции. После греческой революции 1821 года прошло уже шестьдесят лет. За эти десятилетия выросло новое, не жертвенное поколение и произошло колоссальное обмирщение греческой иерархии и священства. Архиереи и священники часто переставали быть образцами духовной жизни и христианской жертвенности. Священство медленно, но верно превращалось в касту наемников, профессионалов «религиозного обслуживания населения» с вполне земными целями и средствами их достижения. Многие тогда стремились стать священниками и архиереями «не ради Иисуса, а ради хлеба куса» и тёплого местечка. Среди одногруппников иеродиакона Нектария по богословскому факультету таких тоже, к сожалению, было немало. А простые люди прекрасно видели всё это и либо молча соблазнялись, либо прямо и агрессивно высмеивали священство. В конечном итоге, и те и другие отходили от Церкви, теряли веру в Бога и вечное спасение.