Ученые обнаружили, что молнупиравир может вызывать появление мутаций коронавируса, причем мутировавший под воздействием препарата вирус может передаваться другим людям. Однако исследователи не выявили признаков, характерных для вызванных молнупиравиром мутаций, среди широко циркулирующих вариантов коронавируса. Ученые считают, что вызванные молнупиравиром мутации ослабляют вирус, а не делают его более опасным.