Позднее частично был затоплен при строительстве Угличского водохранилища 1939-1940 годов. Знаменитые монастыри Калязина канули в лету вместе с большей частью старого города. Миновала эта участь лишь колокольню Никольского собора, которая сейчас возвышается посреди реки. Пятиярусную колокольню высотой более 70 метров возводили крестьяне полковника Василия Федоровича Ушакова, владельца села Никитского, которые обязались выстроить колокольню "согласно плану и фасаду", а в случае неудачно выполненной работы они должны были за свой счет перестроить ее. Однако работали они так добросовестно, что колокольня стоит уже более двухсот лет, 83 года из которых - частично затопленная водой!