Тренерскую карьеру Игорь Грачев начал в октябре 2011 года, возглавил мужской баскетбольный клуб «Самара-2». С 2017 по 2022 годы тренировал мужскую команду «Самара». За этот период клуб дважды выиграл Суперлигу и дважды взял Кубок России. В прошлом сезоне с женской командой из Самары занял 5 место.