Пещера Цагаан-Агуй была остановочным пунктом по меньшей мере для двух крупных миграций в древнейшей истории Азии. Во-первых, это расселение людей среднего палеолита, которые по своей материальной культуре оказались очень схожи с денисовцами. Они обладали хорошими навыками выживания и уже были способны преодолевать пустыни. Вторая миграция — это распространение людей в начале верхнего палеолита. Это были великие путешественники, преодолевшие расстояние от Средиземного моря до Китая. Учёные предполагают, что они были уже очень близки к людям современного анатомического типа.