83 подписчика
Методика показала, что пробелы в ДНК несут много информации и их нельзя игнорировать
Первый шаг, выполняемый аналитиками ДНК - выравнивание известных последовательностей, дабы сравнить их друг с другом. Из-за замен и делеций нуклеотидов (конструкционных элементов ДНК) могут образовываться пробелы, и при выравнивании они превращаются в прерывания столбцов.
Недавно было выяснено, что нельзя говорить о пробелах как о недостатке, а вместо этого необходимо расценивать их как дополнительный источник знаний. Исторически ученые полагают, что места разрывов никак не зависят от самого генома и появляются в случайных точках. Команда исследователей из Государственного универсистета Северной Каролины провела простой тест. Они проанализировали 1390 наборов выравниваний и обнаружили, что ⅔ наборов имели схожие места пробелов. Это говорит о проблематичности нынешнего подхода к выравниванию, и, возможно, о его несостоятельности. А ведь целые эволюционные деревья уже построены с применением этого метода!
«Простого решения не существует, но, надеюсь, это исследование поможет нам помнить о потенциальных ловушках. Нам нужно знать о проблемах с традиционными статистическими методами и работать над их устранением». – Тэ-Кун Сео, главный научный сотрудник Корейского института полярных исследований и соавтор исследования.
1 минута
16 августа 2022