8 октября 1946 года постановлением Совета Министров Народной Республики Болгарии Пограничная милиция была переименована в Пограничные войска. Ситуация на государственной границе в особенности с Турцией и Грецией была очень сложной. Только за период 1947-1950 гг. Количество вооруженных столкновений составило 1446. А в следующие два года пограничники "встретились" еще с 218 вооруженными нарушителями. В этот период большое внимание уделяется инженерно-техническому оснащению границы. С 1959 года в эксплуатации находится элекрическое оборудование, которое в последующие десятилетия стало важным инструментом пограничной безопасности. В 1962 году пограничные войска перешли в ведение Министерства национальной обороны, но пограничные пункты остались в ведении Министерства внутренних дел.