Костенковские скалы отличаются тем, что на всем протяжении Салаирского кряжа нет таких разнообразных и богатых по составу каменисты. Растительных сообществ. Именно скалы, которые находятся на левом берегу реки Чумыш, привлекли внимание ученых. Здесь есть такие интересные виды как можжевельник ложноказацкий, зизифора пахучковидная, змееголовник иноземный, которые больше на Салаире нигде не встречаются. Это и определило уникальность этой территории. А также тут обитают исчезающие виды животных.