176,9 тыс подписчиков
Семнадцатилетний Индивер Мадиредди, учащийся старшей школы из Калифорнии, секвенировал, собрал и аннотировал полный геном обыкновенной скалярии — впервые в истории. Моделью для исследования стала аквариумная рыбка Кельвин, погибшая от естественных причин. По словам Мадиредди, таким образом он решил увековечить память о своем питомце и предоставить новую информацию научному сообществу.
Мадиредди проводил секвенирование с помощью оборудования Oxford Nanopore Technologies в общественной лаборатории BioCurious в Санта-Кларе, Калифорния. Эта лаборатория предоставляет оборудование всем желающим за небольшой членский взнос. Деньги на исследование Мадиредди собрал с помощью краудфандинга, а интерактивную версию генома опубликовал на гитхабе.
Размер генома скалярии и процентное содержание гуанина и цитозина в молекулах оказались аналогичны другим видам рыб, таким как азиатский морской окунь и нильская тиляпия. Более половины (59 процентов) идентифицированных генов оказались ортологичными для цихлозомы колючей, близкой родственницы южноамериканской цихлиды. Вероятно, эти виды разделились в период 28,7 и 72,4 миллионов лет назад.
Около минуты
27 октября 2022
10,8 тыс читали