В начале XVII века Киевская братская школа была одним из лучших православных учебных заведений Речи Посполитой, но проблемы с финансированием поставили её существование под угрозу и в этой обстановке архимандрит Киево-Печёрской лавры Пётр Могила начал претворять в жизнь свой план по созданию в Киеве учреждения высшего образования, названного по имени своего создателя Киево-Могилянской академией.
При создании академии, названной его именем, Пётр Могила опирался на большую материальную базу, ведь помимо переживавшей не самые лучшие времена Киевской братской школы в её состав вошла школа при Киево-Печёрской лавре со своей типографией, также Пётр Могила пригласил в Киев лучших преподавателей из Львовской и Луцкой братских школ. Новое учебное заведение, в котором преподавание было поставлено на западно-европейский манер, быстро развивалось, в ней насчитывалось 8 классов (из них 4 младших, 2 средних и 2 старших), срок обучения в ней обычно составлял 12 лет, при этом студентов не отчисляли оттуда даже при плохой учёбе, а при болезни или тяжёлом материальном положении оказывали помощь. Преподавали же в Киево-Могилянской академии языки, естественную и священную истории, географию, математику, экономику, архитектуру, риторику, живопись, архитектуру и медицину. При своей жизни Пётр Могила позаботился и о материальном положении школы и учащихся, построив для неё каменное здание, существующее до сих пор, а также отписал ей ряд сёл. Статус Киево-Могилянской академии был очень велик, в 1658 году поляки распространили на неё привилегии, которыми был наделён Ягеллонский университет в Кракове, позже это решение подтвердили и русские цари.
На протяжении почти 200 лет Киево-Могилянская академия была лучшим ВУЗом Восточной Европы, в котором учились не только русские студенты, но и иностранцы, благо, преподавание там велось на латыни, главном языке науки того времени (с 1751 года преподование велось на русском языке). Вплоть до 1755 года, когда в Москве был основан университет, Киево-Могилянская академия была единственным учреждением высшего образования в России, да и после этого она давала фору московскому собрату. Окончательно позиции Киево-Могилянской академии пошатнулись только в 1805 году, когда в Харькове был открыт университет, ставший лидером светского высшего образования в Малороссии, что касается Киево-Могилянской академии, то она оставалась более духовным, чем светским учреждением и в 1817 году она была преобразована в семинарию, а через 2 года - в духовную академию, существующую до сих пор.