Создана крупнейшая в мире база данных противоопухолевой активности металлов, сообщили в Минобрнауки РФ
Российские ученые из ИОНХ РАН и МГУ им. М. В. Ломоносова создали базу данных цитотоксичности (способности оказывать разрушительное воздействие на живые клетки) комплексов переходных металлов "MetalCytoToxDB" и разработали модели машинного обучения для предсказания их противоопухолевой активности. База данных включает более 26500 значений IC50 (показатель концентрации вещества, необходимой для подавления активности клеток на 50%) для 7050 комплексов рутения, иридия, родия, рения и осмия
Некоторые металлы в составе специальных химических соединений - "комплексов" - способны проникать в раковые клетки и нарушать их работу: блокировать деление, повреждать ДНК или запускать гибель клетки
Так действует, например, цисплатин - один из самых распространенных препаратов химиотерапии
Однако разработка новых металлсодержащих препаратов долгое время была затруднена: систематизированных данных об их действии на опухолевые клетки практически не существовало
Крупные международные базы данных почти не содержали информации о таких соединениях, что не позволяло применять к ним современные методы искусственного интеллекта
Чтобы восполнить этот пробел, московские химики вручную собрали и систематизировали данные более чем из 1900 рецензируемых научных публикаций
Итогом стала крупнейшая в мире база данных в своей области: она охватывает пять металлов - рутений, иридий, родий, рений и осмий - и содержит результаты испытания более 7 тыс. их соединений на 754 типах опухолевых клеток
На основе собранных данных ученые обучили модели машинного обучения, которые умеют предсказывать, будет ли новое соединение подавлять рост раковых клеток - еще до его синтеза в лаборатории
Модель показала высокое качество при отборе перспективных соединений: она значительно сужает круг веществ - "кандидатов", которые стоит проверить в лаборатории
Показательна проверка на практике: модель обучили на статьях, опубликованных до 2024 года, а затем протестировали на новых работах 2025 года
В 9 случаях из 10 она верно определяла, какие соединения действительно способны подавлять рост опухолевых клеток, что в два раза лучше результатов случайного отбора
