Основатель Могольской империи Бабур в 16в. делает Кабул своей столицей. Вскоре Бабур переселяется в Индию, а территория Афганистана переходит к Сефевидам. В 18в. на фоне ослабления Сефевидов и воцарения в Иране Надир-шаха из династии Афшаридов образуются феодальные афганские ханства.
После убийства Надир-шаха в 1747г. Ахмад-шах Дуррани, пуштунский военачальник персидской армии, стал эмиром Хорасана - первого афганского государства со столицей в Кандагаре. Позже на совете старейшин племён (Лойя Джирга) он был провозглашён шахом, основав таким образом Дурранийскую империю.
Вскоре Ахмад-шах захватывает Газни, а затем Кабул. В 1749г. могольские власти были вынуждены уступить Синд, Пенджаб и важную переправу по реке Инд. После почти годовой осады и кровавой битвы пал Герат, затем Мешхед. В начале 1757г. Ахмад-шах захватывает Дели и берёт Могольскую династию в плен, пока те не признают за ним Пенджаб, Синд и Кашмир.
При его сыне Тимур-шахе (1773-1793) столица государства была перенесена в Кабул. Следующим правителем Империи стал Земан-шах (1793-1801).
Однако его братья не признали первенство Заман-хана, в том числе правитель Герата Махмуд-шах, который в том же 1793г. объявил о независимости Гератского ханства. Вскоре Земан-шах был свергнут своим братом Махмуд-шахом (1801-1803).
После короткого междуцарствия своего брата Шуджа-шаха в 1803-1809гг., Махмуд вторично вступил на престол. Но, казнив своего прежнего союзника Футеха-хана, он навлёк на себя ненависть племени баракзай, к которому принадлежал Футех-хан, и таким образом в 1818г. Махмуд вновь лишился власти. После него правили его братья Али-шах (1818-1819) и Аюб-Шах. При правлении последнего Дуррани лишились Кашмира, и вся страна стремительно рассыпалась. В 1823г. он был свергнут и заточён в тюрьму династией Баракзаев.
Это стало концом правления династии Дуррани и крахом Дурранийской империи. Держава распалась на ряд самостоятельных княжеств - Пешаварское, Кандагарское и Кабульское (ядро будущего эмирата Афганистан).
Независимое к тому моменту Гератское ханство осталось последней вотчиной династии Дуррани, вплоть до его подчинения Афганистану в 1863г.