Степан Михайлович Заборьев родился 30 июня 1921 года в селе Ярки Новохоперского уезда Воронежской губернии. Перед войной проживал в городе Аткарск Саратовской области. Призван 10 декабря 1940 года Аткарским РВК. Первоначально служил в 4864-м зенитном полку, с марта 1941 года – в 28-м гаубичном полку. Участвовал в Великой Отечественной войне с самого её начала. С сентября 1941 года занимал должность командира отделения связи в 652-м артиллерийском полку 202-й моторизованной дивизии, которую переформировали позже в 202-ю стрелковую дивизию.
21 ноября 1942 года в бою за деревню Пустыня (сейчас территория Парфинского района Новгородской области), обеспечивая связь артиллерийской батареи с наблюдательным пунктом, старший сержант Степан Михайлович Заборьев 20 раз под огнём противника устранял обрывы телефонного провода. В тот же день взял в плен немецкого корректировщика артиллерийского огня. За отличие в бою был награждён орденом Красной Звезды (25.11.1942).
С ноября 1942 года – помощник командира взвода в 142-м армейском запасном полку. С апреля 1943 года – командир отделения средних танков Сталинградского танкового училища. С октября 1944 года – командир танка Т-34-85 53-й гвардейской танковой бригады.
В ходе Сандомирско-Силезской операции Степан Михайлович Заборьев неоднократно доставлял ценные разведданные командованию и обеспечивал связь своей бригады с действовавшей по соседству 62-й гвардейской танковой бригадой 10-го гвардейского танкового корпуса. На подступах к городу Велюнь у населённого пункта Щиты (сейчас это Паенченский повят Лодзинского воеводства Польши) гвардии младший лейтенант Заборьев обнаружил колонну противника. Атаковав её в одиночку, он уничтожил немецкий танк Т-VI «Тигр», самоходную артиллерийскую установку и до 35 солдат и офицеров вермахта.
21 января на подступах к реке Одер в районе населённого пункта Халемба экипаж Заборьева в ходе боя уничтожил вражеский танк, противотанковое орудие и до 20 немецких солдат и офицеров. За мужество, отвагу и самоотверженность был награжден орденом Красного Знамени (29.03.1945).
7 февраля 1945 года в бою за населенный пункт Мадлау гвардии младший лейтенант Заборьев умелым манёвром вывел свой взвод во фланг немецкой обороны. В ходе боя экипаж его танка уничтожил вражескую «Пантеру» и 3 противотанковых орудия с автомашинами. Преследуя отступающего противника, он уничтожил 8 автомашин и 30 подвод с грузами, до 50 солдат противника.
В бою за населённый пункт Китлицтребен гвардии младший лейтенант Заборьев уничтожил два немецких танка Т-IV, 3 бронетранспортёра, 20 повозок с грузами и до 40 солдат противника. Форсировав Бобер, танкисты вышли во фланг крупной немецкой группировки и завязали тяжёлые бои в междуречье Бобера и Квейса. 21 февраля 1945 года в бою за Хохкирх танк Заборьева смял немецкую батарею и, зайдя в тыл вражеской танковой засады, уничтожил танк Т-V «Пантера», самоходное орудие и 30 солдат с фаустпатронами. 2 марта 1945 года во встречном бою в районе населенного пункта Гисманнсдорф он подбил 3 «Пантеры» и одно самоходное орудие, уничтожил 2 пушки и до 45-ти немецких солдат. Преодолев Квейс, 5 марта 1945 года гвардии младший лейтенант Заборьев завязал бой с тремя танками противника на железнодорожной станции Зигерсдорф. Две «Пантеры» были уничтожены, но последняя успела сделать выстрел и уничтожить Т-34, экипаж танка погиб. Всего за период с 12 января по 5 марта 1945 года экипаж Заборьева уничтожил 17 танков и самоходных артиллерийских установок противника.
За образцовое выполнение боевых заданий командования указом Президиума Верховного Совета СССР от 27 июня 1945 года гвардии младшему лейтенанту Степану Михайловичу Заборьеву было присвоено звание Героя Советского Союза посмертно.