Хантавирус сопровождает человека очень давно. Первые описания похожей болезни — геморрагической лихорадки, острой вирусной инфекции с массовыми внутренними кровоизлияниями и поражением почек — встречаются ещё в китайском трактате «Хуанди Нейцзин» предположительно II–III вв. до н.э. Сам вирус был неотлучным спутником всех крупных войн: его следы находят в окопном нефрите солдат Гражданской войны в США, во Фландрии в Первую мировую, в частях Вермахта и финской армии в Лапландии в 1942 году, среди военнослужащих Квантунской армии в Маньчжурии — где геморрагическая лихорадка свалила около 10 000 человек. Своё нынешнее название вирус получил в 1976 году: южнокорейский учёный Ли Хо Ван выделил возбудитель из мыши, пойманной у реки Хантан, — той самой, рядом с которой в годы Корейской войны слегли более трёх тысяч солдат ООН с тогда ещё безымянной «корейской геморрагической лихорадкой». В 1993 году вирус впервые объявился в США — в регионе Четыре Угла на стыке Аризоны, Нью-Мексико, Юты и Коло