К такому выводу пришли суды: Постановление АС Московского округа от 31.03.2026 по делу № А40-62663/2025
Как видно из материалов дела, недоимка организации по НДС за 1 квартал 2019 года и пени по ней были признаны безнадежными . Однако затем организация обнаружила у себя отрицательное сальдо ЕНС. Как оказалось, инспекция сформировала сальдо ЕНС без учета решения суда о безнадежной задолженности (списала деньги с ЕНС в ее погашение). Организации пришлось судиться еще раз.
Суд признал действия налоговиков незаконными:
▪️платежи организации нельзя учитывать в счет погашения безнадежной недоимки. Их засчитывают в счет совокупной обязанности по ЕНС по налогам за иные периоды;
▪️деньги, поступившие на ЕНС, участвуют в погашении общей совокупной обязанности на дату поступления платежа, а не конкретной обязанности. Однако налоговики определяют принадлежность денег как ЕНП на основе суммы совокупной обязанности на ЕНС в последовательности по НК РФ;
▪️инспекция нарушила эту последовательность, она неправомерно зачла деньги в счет погашения недоимки по НДС за 1 квартал 2019 года.