Согласно данным многолетних исследований, Таганрогский залив Азовского моря значительно более загрязнён пестицидами, чем его открытая акватория. Основной причиной этого учёные называют сельскохозяйственные стоки, которые реки Дон и Кубань несут в восточную часть моря, превращая её в своеобразный накопитель химикатов. Специалисты Азовского научно-исследовательского института рыбного хозяйства (АзНИИРХ) на протяжении почти десяти лет проводят мониторинг, анализируя содержание агрохимикатов в воде, донных отложениях и тканях рыб. Хотя прямое содержание пестицидов часто не превышает установленных пределов и не приводит к массовой гибели рыбы, эксперты предупреждают о серьёзных косвенных рисках. Гербициды способны угнетать рост фитопланктона — основы пищевой цепи, а инсектициды негативно влияют на зоопланктон, ли лишая мальков и молоди рыб кормовой базы. Это подрывает воспроизводство водных биоресурсов. Кроме того, химикаты представляют опасность для промысловых беспозвоночных, таких как раки и креветки, что наносит ущерб рыбному хозяйству. Несмотря на переход на более современные и менее токсичные препараты, проблема попадания пестицидов в экосистему сохраняется, что требует продолжения системного контроля и научной работы.