Ратификация Брестского мира не сняла напряженности в правящей коалиции. «Левые коммунисты» продолжали выступать за денонсацию договора. Кульминацией их противостояния с большевиками стали события 6–7 июля 1918 г. в Москве, вошедшие в историю как «левоэсеровский мятеж».
Сотрудники ВЧК, левые эсеры Я. Блюмкин и Н. Андреев, убили германского посла графа В. Мирбаха, после чего укрылись в штабе войск ВЧК под командованием их однопартийца Д. Попова. Председатель ВЧК Ф.Э. Дзержинский, прибывший в штаб для ареста убийц, был сам задержан. В ответ В.И. Ленин приказал арестовать фракцию левых эсеров на V Всероссийском съезде Советов и подавить выступление силами латышских стрелков под командованием И.И. Вацетиса. К утру 7 июля мятеж был подавлен.
Советская историография квалифицировала эти события как сознательно подготовленное руководством партии левых эсеров (М. Спиридонова, П. Прошьян) выступление с целью денонсации Брестского мира и отстранения большевиков от власти. В зарубежной историографии встречается версия о возможной причастности к провокации «левых коммунистов» в лице Ф.Э. Дзержинского.
Июльские события стали переломным моментом в развитии советской государственности. Они положили конец двухпартийной системе (большевики — левые эсеры) и начали формирование однопартийной политической системы. После подавления мятежа была запрещена деятельность эсеровских, меньшевистских и анархистских организаций. Сам Брестский мирный договор был денонсирован СНК РСФСР 13 ноября 1918 г., на следующий день после капитуляции Германии.