В Донском филиале и других филиалах ЦОК АПК системно проводится обучение по программам повышения квалификации. Так, в 2025 году на базе Донского филиала проведено обучение по 8 программам повышения квалификации, обучено 232 слушателя. В форме обучающих семинаров состоялось 6 семинаров, повышение квалификации прошли 296 человек, в т.ч. 151 слушатель – из сторонних организаций и 145 работников ФГБУ «ЦОК АПК»
В текущем 2026 году на базе испытательного центра Донского филиала разработана и реализуется новая профессиональная программа повышения квалификации под названием «Хроматографические методы исследования объектов ветеринарного надзора, объектов окружающей среды, плодовоовощной продукции, вегетативных частей растений, зерна и продуктов его переработки (жидкостная и газовая хроматография, жидкостная и газовая хромато-масс-спектрометрия)». В марте 2026 года Донской филиал ФГБУ «ЦОК АПК» провел обучение по дополнительным профессиональным программам повышения квалификации для работников Уч