6 марта 1930 года в Пятницкой церкви состоялось последнее богослужение. После этого церковь была закрыта. В те же годы её хотели и разобрать, но в итоге, лишившись колокольни и купола, здание простояло до 1961 года, когда его снесли при расширении проспекта Победы.
Когда точно церковь была построена в каменном виде - неизвестно. Предполагают, что это конец 17 или начало 18 веков. Позднейшие пристройки и перестройки исказили первоначальный вид церкви. Возможно, они затронули и колокольню, придав необычные пропорции, которые считались не иначе как курьёзные.
Наименование церкви дало название Пятницкой улице (современная ул. Мальцева), Пятницкому бульвару, Пятницкому пруду и Пятницкому мосту. Пруды были засыпаны в конце 1930-х и на их месте сейчас стадион у перекрёстка проспекта Победы и Ленинградской. А мост пропал с карт города ещё раньше, когда перестал существовать ров вологодского кремля Ивана Грозного, через который он и был обустроен.