Начало становлению министерской системы управления в России положено 20 сентября 1802 года Манифестом «Об учреждении министерств».
Первыми восемью министерствами становятся: военных сухопутных сил, морских сил, иностранных дел, юстиции, внутренних дел, финансов, коммерции, народного просвещения.
Коллеги и подчиненные им места переходят под контроль министров. Каждый подчиненный орган представляет своему министру еженедельные мемории о текущих делах. Министр отвечает на них предложениями. Подчиненные органы в случае несогласия с предложениями министра представляют ему рассуждения. Если последний настаивает на своем предложении, то оно исполняется, а мнение подчиненных органов заносится в журнал. Коллеги не упраздняются, а продолжают действовать в подчинении министрам и подлежат постепенному сокращению в будущем. В помощь министрам назначаются товарищи министров, которые могут замещать последних в период их отсутствия.
Ответственность министров перед Сенатом, впрочем, остается только на бумаге: Сенат не имеет реальных рычагов контроля над правительством. Непосредственное подчинение министров императору и право личных докладов ему исключают возможность сенатского контроля.