24 подписчика

Protein2PAM: ИИ расширяет возможности CRISPR

8 февраля8 фев

~1 мин

Калифорнийский стартап Profluent представил Protein2PAM – языковую модель для белков, опубликованную в Nature Biotechnology. Она предсказывает и изменяет PAM-специфичность CRISPR-Cas ферментов, минуя длительные лабораторные эксперименты. Модель обучена на более чем 45 000 парах Cas-белков и PAM-последовательностей, позволяя создавать варианты Cas9, способные редактировать ранее недоступные участки ДНК. В лабораторных условиях скорость разрезания ДНК увеличилась до 50 раз. Protein2PAM решает проблему ограничения технологии CRISPR, связанную с необходимостью наличия PAM-последовательности рядом с целевым участком ДНК. Благодаря модели, можно предсказывать PAM-распознавание Cas-белков и генерировать варианты с расширенным спектром распознавания, используя виртуальный мутагенез. Разработчики предоставили открытый доступ к обучающим данным и весам Protein2PAM. Несмотря на то, что до клинического применения еще далеко, технология может значительно расширить возможности CRISPR-терапии и упрос

Модель обучена на более чем 45 000 парах Cas-белков и PAM-последовательностей, позволяя создавать варианты Cas9, способные редактировать ранее недоступные участки ДНК. В лабораторных условиях скорость разрезания ДНК увеличилась до 50 раз.

Protein2PAM решает проблему ограничения технологии CRISPR, связанную с необходимостью наличия PAM-последовательности рядом с целевым участком ДНК. Благодаря модели, можно предсказывать PAM-распознавание Cas-белков и генерировать варианты с расширенным спектром распознавания, используя виртуальный мутагенез.

Разработчики предоставили открытый доступ к обучающим данным и весам Protein2PAM. Несмотря на то, что до клинического применения еще далеко, технология может значительно расширить возможности CRISPR-терапии и упростить подбор инструментов редактирования генома.

В общем, теперь ИИ будет решать, где и что резать в нашем геноме, а ученые пусть сидят и удивляются, как это все работает. Ну, или ищут работу.