Кубаткин Петр Николаевич родился в 1907 году в Елизаветградской губернии в семье шахтера Кольберовского рудника. С 1921 по 1927 год работал на шахте. В 1927 — 1929 годах находился на комсомольской работе.
В органах госбезопасности — с сентября 1929 года. В 1929 — 1932 годах служил в пограничных войсках. С 1932 по 1937 год — в подразделениях госбезопасности Одесской области. В 1937 году окончил Центральную школу НКВД СССР. Затем работал в подразделениях центрального аппарата НКВД. В 1939 году — секретарь парткома ГУГБ НКВД СССР.
В 1939 — 1941 годах руководил Управлением госбезопасности Московской области. С августа 1941 года по июнь 1946 года возглавлял Управление госбезопасности Ленинградской области. Одновременно в 1945 году являлся уполномоченным НКГБ СССР по 2—му Прибалтийскому фронту.
С 15 июня по 7 сентября 1946 года возглавлял внешнюю разведку органов госбезопасности. Генерал—лейтенант.
С 1946 по 1949 год работал начальником УМГБ Горьковской области. В апреле 1949 года назначен заместителем председателя Саратовского облисполкома.
Награжден орденами Ленина, Красного Знамени, Кутузова I степени, Кутузова II степени. Трудового Красного Знамени, двумя орденами Красной Звезды, медалями, а также нагрудным знаком "Заслуженный работник НКВД".
23 июля 1949 года арестован в связи с так называемым "ленинградским делом". 27 октября 1950 года расстрелян.
Реабилитирован посмертно 26 мая 1954 года.