Новый алгоритм на основе полногеномного секвенирования превзошёл коммерческие тесты в определении эффективности PARP-ингибиторов.
Исследователи из Медицинского колледжа Вейлл Корнелл и больницы Нью-Йорк-Пресвитериан представили новый метод, который может значительно улучшить подбор терапии для онкологических пациентов. Речь идёт о применении полногеномного секвенирования (WGS – метод, позволяющий «прочитать» всю последовательность ДНК организма) для выявления дефекта в системе восстановления ДНК, известного как недостаточность гомологичной рекомбинации (HRD). Опухоли с таким дефектом особенно уязвимы к таргетным препаратам – ингибиторам PARP (поли-АДФ-рибозо-полимеразы), которые блокируют один из ключевых ферментов, ремонтирующих повреждённую ДНК в раковых клетках, что приводит к их гибели.
Почему старый подход устарел?
До сих пор врачи в основном ориентировались на поиск мутаций в генах BRCA1 и BRCA2 – самых частых причин HRD. Эти мутации часто встречаются при раке молочной железы, яичников, поджелудочной железы и простаты. Однако, как показывает наука, сбой в системе восстановления ДНК могут вызывать и множество других генетических поломок. Традиционные коммерческие тесты, которые ищут лишь определённые мутации, могут не заметить этих альтернативных дефектов, и пациент не получит потенциально эффективное лечение.
Как работает новая методика?
Учёные проанализировали сотни образцов опухолей, используя технологию полногеномного секвенирования. На основе этих данных они совместно с компанией Isabl, Inc. (специализирующейся на медицинской диагностике) обучили и проверили специальный алгоритм. Этот алгоритм сканирует весь геном на наличие широкого спектра «рисунков» повреждений ДНК, характерных для HRD, а не только ищет известные мутации в конкретных генах.
В ходе валидации (проверки) на большой группе из 556 образцов рака и дополнительном сравнении с коммерческими методами на 212 образцах новый алгоритм показал более высокую точность в прогнозировании ответа на терапию PARP-ингибиторами.
Ключевые цифры и важные выводы
Алгоритм выявил дефицит репарации (восстановления) ДНК в 21% образцов рака молочной железы, 20% — опухолей поджелудочной железы и желчных протоков, а также в 17% гинекологических опухолей. Важнейшее наблюдение: в 24% случаев, когда дефект был обнаружен, он НЕ был связан с мутациями в генах BRCA1 или BRCA2. Это доказывает, что причин уязвимости опухоли к PARP-ингибиторам гораздо больше, чем считалось ранее.
«Всесторонний анализ всего генома имеет преимущества по сравнению с традиционными целевыми стратегиями обнаружения для прогнозирования недостаточности гомологичной рекомбинации», — отметил старший автор исследования, доктор Хуан Мигель Москера, профессор патологии и лабораторной медицины, директор по исследовательской патологии в Институте прецизионной медицины им. Ингландера при Вейлл Корнелл и патологоанатом в медицинском центре Нью-Йорк-Пресвитериан/Вейлл Корнелл. Доктор Москера также входит в состав Онкологического центра Сандра и Эдвард Мейер при Вейлл Корнелл.
В нескольких случаях алгоритм смог предсказать эффективность лечения там, где коммерческие методы не совпадали с реальными результатами пациентов, что указывает на его потенциально более высокую точность.
Что дальше?
Исследовательская группа планирует проведение более масштабных исследований, чтобы утвердить новый алгоритм в качестве универсального инструмента для помощи врачам в принятии решений о лечении рака. Внедрение полногеномного секвенирования в рутинную практику может открыть путь к персонализированной терапии для большего числа пациентов, обеспечивая лечение тем, кто действительно на него ответит.
Автор: Издание «МЕДИК»
«МЕДИК» Зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор) от 17.03.2025г. ЭЛ №ФС77-89146. Сайт издания: https://medik.press
Теги:
PARP ингибиторы, полногеномное секвенирование, персонализированная онкология, недостаточность гомологической рекомбинации, рак молочной железы, таргетная терапия рака, прецизионная медицина
Meta description:
Новое исследование от учёных Вейлл Корнелл предлагает использовать полногеномное секвенирование для точного выявления пациентов, которым помогут PARP ингибиторы. Алгоритм находит больше генетических причин уязвимости опухоли, чем стандартные тесты.
URL для публикации:
https://medik.press/proryv-v-onkologii-polnoe-genomnoye-sekvenirovaniye-parp-ingibitory
Раздел для публикации: Инновации в онкологии