Вправе запретить: родитель, усыновитель, опекун, попечитель. И не важно, что папа давно не видел свое чадо и имеет долг по алиментам, по закону он вправе запретить ребенку покидать территорию РФ, осложнив жизнь мамы и лишив ребенка приятного отдыха на море или поездки на учебу. Заявление подается ЛИЧНО: в России — в отдел по вопросам миграции МВД (форма тут (https://ivo.garant.ru/#/document/402888393/paragraph/193/doclist/5984:0))