Научно-исследовательское и природоохранное учреждение федерального значения образовалось 21 января 2006 года, узнал СМИ44.
По данным министерства природных ресурсов РФ, в бассейнах рек Унжа и Нея, где образован заповедник «Кологривский лес», сохраняются уникальные для европейской части России южно-таёжные комплексы, в которых соседствуют растения, характерные для хвойных и широколиственных лесов.
В феврале 2009 года «Кологривскому лесу» было присвоено имя Максима Синицына, который стоял у истоков создания заповедника и был его первым директором, а в октябре 2020 года заповедник «Кологривский лес» был включён во Всемирную сеть биосферных заповедников ЮНЕСКО.
Из более чем 550 видов сосудистых растений, обнаруженных на сегодняшний день в заповеднике, 61 вид занесён в Красную книгу Костромской области. В их числе – находящиеся под угрозой исчезновения в регионе диплазиум сибирский, гроздовник виргинский и осока волосовидная. Получаемые данные пополняют базу долговременного экологического мониторинга и помогают в разработке дальнейших мер по сохранению флоры и фауны.
За прошедшие 20 лет коллективу заповедной территории удалось выстроить системную работу во всех сферах деятельности – научной, природоохранной и эколого-просветительской. С 2012 года в школах и детских садах Кологривского района реализуется программа экологического образования «Лесная академия». В ходе этой программы сотрудники заповедника ежегодно проводят более 140 занятий, участниками которых являются около 3 тысяч школьников и дошкольников.
Развивается в заповеднике и экологический туризм.