Иван Николаевич Шихов родился в 1894 году на Вятской земле. Затем семья переехала в Уфу, где отец Шихов Николай Евсеевич служил на железной дороге. Жили они на улице Спасской, ныне улице Октябрьской революции и рядом с домом была церковь и овраг, а за оврагом располагалась мечеть. Над крышами домов плыл колокольный звон. Иван Николаевич был третьим ребёнком в семье.(Судьба Ольги и Арины неизвестна) Родители рано определили его путь, отдав в монастырь на воспитание. Вместо шумных игр его ждала тихая келья и свет свечей. Он стал монахом, сменив мирское платье на чёрную рясу, и прошёл суровую школу Духовной семинарии. Это была жизнь, полная веры и смирения, в самом сердце старого города. В 1928 году Отец Иоанн нёс свет веры в Михайло- Архангельском Храме села Зирган. Его служение было прервано суровым временем: 12 ноября 1928 года , в преддверии зимних холодов, он был арестован и обвинен по статье 58–10 — за слово и веру. Он прошёл через горнило испытаний в трехлетней ссылке в краснояр