В состав питательных сред могут входить различные органические и неорганические вещества целевого назначения. Некоторые аминокислоты (лизин, орнитин, аргинин, глутаминовая кислота) вводятся в состав сред для определения декарбоксилазной активности микроорганизмов, цистин — для определения цистиназы и в качестве стимулятора, триптофан — для определения индоло-образования, фенилаланин — для определения дезаминазы, мочевина — для определения уреазной активности, соли лимонной, малоновой и винной кислот — для определения способности микробов утилизировать эти соединения как единственный источник углеродного питания; О-нитрофенил β-D-галактопиранозид — для определения фермента галактозидазы. Желток яиц используется в качестве субстрата для определения лецитиназы и липазы, желатин — для выявления протеолитических ферментов, соли железа — для определения сероводорода.